2012年度(平成24年度)

コース名  化学コース

領域名   機能物質化学領域

教員名   村田 武士

電子メール t.muratafaculty.chiba-u.jp

      ※メール送信の際は、「理」を半角@に変更してください。

 

(1)      研究論文などのリスト(印刷中を含む)

 

<原論文(査読有り)>

Zahed Muhammed, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Ichiro Yamato, Takeshi Murata, *Atsushi Suenaga (2012) Calculating the Na+ translocating V-ATPase catalytic site affinity for substrate binding by homology modeled NtpA monomer using molecular dynamics/free energy calculation, J. Mol. Graph. Model., 37, 59-66

Shiroishi M, Tsujimoto H, Makyio H, Asada H, Yurugi-Kobayashi T, Shimamura T, Murata T, Nomura N, Haga T, *Iwata S, *Kobayashi T (2012) Platform for the rapid construction and evaluation of GPCRs for crystallography in Saccharomyces cerevisiae, Microb. Cell Fact., 11, 78

Miyuki Kawano-Kawada, Tomoko Iwaki, Toshiaki Hosaka, Takeshi Murata, Ichiro Yamato, Michio Homma, and *Yoshimi Kakinuma (2012) Mutagenesis of the residues forming an ion binding pocket of the NtpK subunit of Enterococcus hirae V-ATPase, J. Bacteriol., 194, 4546-4549

Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshimi Kakinuma, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru, Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Ichiro Yamato and *Takeshi Murata (2013) Rotation mechanism of Enterococcus hirae V1-ATPase based on asymmetric crystal structures; Nature, 493, 703-707

*Suhaila Rahman, Ichiro Yamato, Shinya Saijo, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata and Takeshi Murata (2013) Biochemical and biophysical properties of interactions between subunits of the peripheral stalk region of human V-ATPase; PLoS ONE, 8, e55704

<著書>

日野智也、岩田想、*村田武士 (2012) 「機能性抗体による創薬標的Gタンパク質共役型受容体の不活性化の分子機構」、「Current Topics実験医学Vol. 30 No. 12, 1937-1939

日野智也、岩田想、村田武士 (2012) 抗体を用いた膜タンパク質の結晶構造解析新機能抗体開発ハンドブック, NTS, 389-394

 

2)卒業研究、大学院修士および博士論文修了指導人数

卒業研究(理学士) 3     大学院修士 4     大学院博士 1

 

3)国際会議出席と招待リスト

<招待講演>

村田武士 機能性抗体によるGPCR不活性化の分子メカニズム、第9回GPCR研究会、お台場、2012511

村田武士 結晶構造から見えてきたV1モーターの回転メカニズム、第二回分子モーター討論会、東京、201268

村田武士 膜タンパク質の結晶性を向上させる機能性抗体作製法の開発、第45回構造生物応用研究会、伊豆、2012615

村田武士 Biacoreを用いて選抜された抗体とヒト膜受容体の共結晶構造解析の実際BIA Symposium 2012、東京、2012720

村田武士 回転分子モーターV1-ATPaseの高分解能結晶作製の秘策はサンプル調製法にあった、大阪大学蛋白質研究所セミナー(高難度結晶の分解能向上に秘策はあるか?)、大阪、2012920

村田武士 V-ATPaseの構造と機能、大阪大学蛋白質研究所セミナー(包括脳ネットワーク研究会)、大阪、2012104

Takeshi Murata  Molecular basis of G-protein coupled receptor inactivation by an allosteric inverse-agonist antibody The 3rd International Symposium of Drug Discovery and Design by NMR横浜、20121011

村田武士 GPCRの構造解析と創薬へのトライアル、第15回ゲノム創薬フォーラム(ゲノム創薬10余年の進展)、東京、2012112

村田武士 機能性抗体によるGPCR不活性化の分子メカニズム、島根大学セミナー、出雲、20121017

村田武士 膜超分子モーター(V-ATPase)の分子メカニズム、鳥取大学セミナー、鳥取、20121019

Takeshi Murata  Crystallization of membrane proteins using functional antibody fragments AsCA 12/CRYSTAL 28 and Bragg Centennial Symposium、オーストラリア(アデレード)、2012123

 

4)教育業績 (自己申告、テキストの作成など、授業の工夫など)

@     千葉大学理学部1年次対象「化学基礎セミナー」 2単位 

A     千葉大学理学部2年次対象「細胞生化学」 2単位

B     千葉大学理学部4年次対象「卒業研究」(3名) 6単位

C     千葉大学大学院理学研究科修士過程対象「生化学特論」 2単位

D     千葉大学大学院理学研究科修士過程対象「基礎生化学」 3コマ

 

5)学会、国、県などへの協力,地域・社会と連携した教育・研究活動など

<学会委員>

平成24年度生物物理学会分野別専門委員

 

6)特許(発明者名,発明の名称,出願日,出願番号,整理番号等) 

なし

 

7)その他 

<紹介記事>

日経プレスリリース 2013114日 千葉大や京大など、VATPaseの回転分子モーター部分の詳細構造を解明

マイナビニュース  2013114日 千葉大など、分子モーター「VATPase」の回転機構を詳細に解明